Missing coverage evidence...
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ATAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAC  >  minE/2051487‑2051533 |                                               aTAGCGACCGTTTTCGCCGCGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:570935/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACTAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:292639/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:782335/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:562162/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:57583/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:587856/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:590381/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:59124/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:629001/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:637723/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:651443/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:747747/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:492734/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:784896/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:796599/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:812672/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:814071/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:831595/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:841628/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:854696/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:866274/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:921157/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:998242/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:174697/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:1060190/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:1062941/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:1116745/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:112452/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:1127072/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:113108/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:1165489/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:1167507/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:133496/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:145038/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:527126/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:175784/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:247318/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:284151/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:320319/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:377189/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:390810/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:393575/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:396988/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:478694/47‑1 (MQ=255) aTAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAc  <  1:1004713/47‑1 (MQ=255) |                                               ATAGCGACCGTTTTCGCCACGAATACGTAAGCCCATATCGTGCCCAC  >  minE/2051487‑2051533

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑