Missing coverage evidence...
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TTGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGA  >  minE/2055759‑2055820 |                                                              ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAAcc                             >  1:98657/1‑35 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGCCCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:184779/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTg              >  1:239017/1‑50 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCgg   >  1:634475/1‑61 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCgg   >  1:688107/1‑61 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:502131/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:497633/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:528459/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:570881/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:646118/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:760720/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:849299/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:866934/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:909280/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:920099/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:938171/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:960378/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:1082842/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:368195/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:363046/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:354777/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:337244/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:328699/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:303038/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:290400/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:287771/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:161207/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:156305/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:1193464/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:1188517/1‑62 (MQ=255) ttGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:1153886/1‑62 (MQ=255) ttGGCTAGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGa  >  1:69167/1‑62 (MQ=255) |                                                              TTGGCTGGGATCTCACCGGAGTAATGGCGGGAACCTGGTTACTGACCGTGCTATTGAGCGGA  >  minE/2055759‑2055820

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑