Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2103603	2103644	42	12 [0]	[0] 61	agaR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

ATCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGTCGCTCGC  >  minE/2103645‑2103706 |                                                              aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATg                     >  1:492276/1‑43 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTtct            >  1:445682/1‑52 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:762584/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:505146/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:582656/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:599097/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:604454/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:616443/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:631231/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:661349/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:694068/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:698711/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:701576/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:731038/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:735997/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:744280/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:418298/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:777271/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:782213/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:788104/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:825222/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:829147/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:832832/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:846103/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:865337/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:917423/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:929442/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:942037/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:949522/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:953797/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:973063/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1193053/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1039257/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1041355/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1056152/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1084157/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1090608/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1091343/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1097248/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1097666/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1099263/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1112306/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1115152/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1162609/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1173258/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1192188/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:1019988/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:141937/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:148385/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:162696/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:168346/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:182396/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:198578/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:207177/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:255278/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:28335/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:31206/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:315244/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:324909/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:346273/1‑62 (MQ=255) aTCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGtcgctcgc  >  1:416083/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATCGTTAACCTGCACACTCCCTTGCTGTCGCAGACGCTGAATGATCTGTTCTCGTCGCTCGC  >  minE/2103645‑2103706

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑