Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2109828	2109857	30	9 [0]	[0] 37	agaC	N‑acetylgalactosamine‑specific enzyme IIC component of PTS

TTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTG  >  minE/2109858‑2109919 |                                                              tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTGTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1132838/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:82793/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:55656/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:583219/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:60328/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:626423/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:735580/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:742550/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:742638/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:755641/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:808108/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:50760/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:854706/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:857669/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:859676/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:889847/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:91830/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:973637/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:982259/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:185703/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1037075/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1102046/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1112547/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1152718/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1187881/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1203049/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:121050/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:160619/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:511814/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:192108/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:199167/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:350453/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:371578/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:383988/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:421707/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:456761/62‑1 (MQ=255) tttATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTg  <  1:1026596/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTATTCCGCCCGATAATCGTTTGTACCCTAACTGGCGCTATTCTCGGTGATATTCAGACTG  >  minE/2109858‑2109919

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑