Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2141676	2141784	109	5 [1]	[0] 49	nusA	transcription termination/antitermination L factor

TATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAACA  >  minE/2141785‑2141846 |                                                              tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:739848/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:580193/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:593708/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:600083/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:608719/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:61809/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:636531/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:68688/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:694112/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:706692/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:730560/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:733141/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:453825/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:783728/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:836034/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:848658/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:852600/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:874016/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:932556/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:936372/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:940589/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:969191/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:982769/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:983955/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:212355/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1023849/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1040428/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1066793/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1097408/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1147316/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1160515/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1171563/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:166195/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:189923/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:199556/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:210045/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:1003939/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:233406/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:290449/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:293066/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:31225/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:346413/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:368526/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:386213/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:396330/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:397451/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:409943/62‑1 (MQ=255) tATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACAGCCTGAaca  <  1:272543/62‑1 (MQ=255) tATCAACCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAaca  <  1:871704/62‑1 (MQ=255) |                                                              TATCATCCCACAGGACGATATCGATACGCTCGCCACCCAGTTCAGTAGACACCGCCTGAACA  >  minE/2141785‑2141846

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑