Missing coverage evidence...
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ATCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAATT  >  minE/2141894‑2141954 |                                                             aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGACCCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAAtt  >  1:665291/1‑61 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGc               >  1:822626/1‑48 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCgc            >  1:1135826/1‑51 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAAtt  >  1:732549/1‑61 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAAtt  >  1:47609/1‑61 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAAtt  >  1:489470/1‑61 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAAtt  >  1:503039/1‑61 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAAtt  >  1:506208/1‑61 (MQ=255) aTCGTTGGTTTTCACCGCGATTTTCGCACGAGAACCCGGATCGCGAGCCGCTGCTTTAAtt  >  1:523107/1‑61 (MQ=255) 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Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑