Missing coverage evidence...
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TTCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCA  >  minE/2187722‑2187781 |                                                            ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAAcc   >  1:70214/1‑59 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:435172/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:965780/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:943059/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:934584/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:932807/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:880425/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:852154/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:783860/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:764818/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:656806/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:643423/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:638337/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:579190/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:454732/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:439623/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:282513/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:1110315/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:116861/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:1189342/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:135907/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:197355/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:208923/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:231393/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:280681/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:104384/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:284530/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:317587/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:319305/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:397363/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:42525/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCa  >  1:428233/1‑60 (MQ=255) ttCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCAAACCa  >  1:654045/1‑60 (MQ=255) |                                                            TTCGGTGAGTACCAGGGCGATTAAAACGAAATCAAAACCGTCAAGCAGATATCCCAACCA  >  minE/2187722‑2187781

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑