Missing coverage evidence...
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CAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGC  >  minE/2193568‑2193624 |                                                         cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:346591/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:962496/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:875897/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:805244/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:790619/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:717853/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:599128/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:494700/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:35428/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:1062831/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:330597/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:322571/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:266085/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:235706/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:199956/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:1133212/57‑1 (MQ=255) cAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACcgc  <  1:110732/57‑1 (MQ=255) |                                                         CAGTTTACGGAACATAGCACGACCCAGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGC  >  minE/2193568‑2193624

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑