Missing coverage evidence...
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GGTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAA  >  minE/2253876‑2253937 |                                                              ggTCAGTTCGTCGGTCTGACTCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1519/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:660148/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:317310/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:353716/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:377161/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:381639/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:41999/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:477041/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:503964/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:563126/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:573729/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:594865/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:632035/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:302380/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:675396/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:69967/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:716077/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:755367/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:763134/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:808288/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:834797/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:840944/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:891213/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:898444/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:907986/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:923146/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:124644/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1057151/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1082154/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1127030/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1137338/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1139733/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1140170/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1146721/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1157214/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1167060/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:1174076/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:118541/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:120042/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:105454/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:155602/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:212791/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:229343/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:230434/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:236040/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:244646/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:263234/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:264014/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:265392/1‑62 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACa   >  1:238779/1‑61 (MQ=255) ggTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGCCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACaa  >  1:470737/1‑62 (MQ=255) |                                                              GGTCAGTTCGTCGGTCTGACGCGTAATGGTCTGGCCGTCGATCATGTCAGTAAAGCGTACAA  >  minE/2253876‑2253937

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑