Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2380588	2380641	54	17 [0]	[0] 28	rmuC	predicted recombination limiting protein

CACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGC  >  minE/2380642‑2380703 |                                                              cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTgg                           >  1:935430/1‑37 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTAtt                   >  1:177951/1‑45 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:534484/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:996269/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:965181/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:923887/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:878235/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:797075/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:720040/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:689382/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:674012/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:646720/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:600360/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:569938/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:1036184/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:529127/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:520655/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:408260/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:364800/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:280770/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:242306/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:149707/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:1192132/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:107590/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcgc  >  1:1038405/1‑62 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcg   >  1:525863/1‑61 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcg   >  1:647015/1‑61 (MQ=255) cACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAgcgcg   >  1:176474/1‑61 (MQ=255) |                                                              CACCCGCGTCAATACTACCTCGCCCCAGTTGCCCTGGGTTTTATTGTCGCCTTTCAGCGCGC  >  minE/2380642‑2380703

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑