Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2381016	2381074	59	31 [0]	[0] 22	rmuC	predicted recombination limiting protein

ACTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGTTT  >  minE/2381075‑2381136 |                                                              aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCtt                   >  1:250540/1‑45 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTgttgtt   >  1:1129119/1‑61 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTgttgtt   >  1:468961/1‑61 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGtttttt  >  1:943905/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:513327/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:956352/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:955963/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:92824/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:921133/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:855126/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:827362/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:726618/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:551124/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:539672/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:1032835/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:457467/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:391648/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:334363/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:297606/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:235178/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:199973/1‑62 (MQ=255) aCTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGttt  >  1:1099545/1‑62 (MQ=255) |                                                              ACTTCGTTATTGAGTAACTCGCACTCTGCACGCCAGTGCTCGCTTTGGGTAATTTGTTGTTT  >  minE/2381075‑2381136

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑