Missing coverage evidence...
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GGTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAC  >  minE/2446173‑2446233 |                                                             ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTaaa   >  1:569893/1‑60 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTa     >  1:866734/1‑58 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:514439/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:988531/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:976768/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:969180/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:968536/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:842330/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:822337/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:81069/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:723854/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:710920/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:589317/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:549470/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:54416/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:1011159/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:466960/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:453748/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:407174/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:36523/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:36358/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:345798/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:337236/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:318046/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:302088/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:274776/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:143580/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:1120956/1‑61 (MQ=255) ggTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAc  >  1:1107293/1‑61 (MQ=255) |                                                             GGTTGTGCTCTGGCAGATGGCAACGTGTGCGACGTCCACCAGTTTATTTAACTGACTAAAC  >  minE/2446173‑2446233

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑