Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2482018	2482055	38	2 [0]	[0] 46	mdtL	multidrug efflux system protein

ACGTACGTGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAC  >  minE/2482056‑2482116 |                                                             acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTg                         >  1:1116267/1‑38 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGa   >  1:625787/1‑60 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:832263/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:516354/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:553623/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:614790/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:722259/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:739255/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:740576/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:770060/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:775164/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:822954/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:82807/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:481430/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:83984/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:851410/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:867793/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:868248/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:8817/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:906445/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:942124/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:959123/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:960980/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:156202/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1011021/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:101535/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1043909/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1083865/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1104661/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1130462/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1131066/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1152573/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1167238/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:127669/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:1002394/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:198439/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:299212/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:321050/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:334825/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:362926/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:415842/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:42538/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:425761/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:447831/1‑61 (MQ=255) acgtacgtGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:462932/1‑61 (MQ=255) acgtacgaGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGCAGAATGAAACGGTCATGCTGAc  >  1:894453/1‑61 (MQ=255) |                                                             ACGTACGTGGCTTAAAAATTCCCAGCGCAAATGGCGTGGAGAATGAAACGGTCATGCTGAC  >  minE/2482056‑2482116

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑