Missing coverage evidence...
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ATTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGT  >  minE/2494875‑2494935 |                                                             aTTCGTACTGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:1196210/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:804928/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:342195/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:363223/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:429248/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:449939/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:515025/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:525552/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:56978/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:616109/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:342134/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:810873/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:837718/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:914324/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:923275/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:928832/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:980373/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:1046963/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:336086/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:322327/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:30589/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:261937/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:243922/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:221750/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:18918/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:185305/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:142445/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:131485/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:1125462/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:107040/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:1063532/61‑1 (MQ=255) aTTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGt  <  1:105213/61‑1 (MQ=255) |                                                             ATTCGTAATGAGCCTGAACCCATCGCAGCGCAGCGTATCGCTATCAGCGAACGTCCCGCGT  >  minE/2494875‑2494935

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑