Missing coverage evidence...
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AGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGTGTG  >  minE/2496753‑2496813 |                                                             aGCTTTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:757160/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAacac        >  1:831797/1‑55 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:563943/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:55537/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:582827/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:584811/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:591742/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:607643/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:649044/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:749263/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:750610/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:753280/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:760343/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:895742/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:898091/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:913294/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:918667/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:928470/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:931310/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:266637/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:1112268/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:1115383/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:1133383/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:1178462/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:124679/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:153228/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:161084/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:202126/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:107553/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:271753/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:300041/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:309767/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:322880/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:44317/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:484779/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:506810/1‑61 (MQ=255) aGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGtgtg  >  1:524892/1‑61 (MQ=255) |                                                             AGCTGTTGTGCACGCGGTATCTCAAGGAGAAACGTTGTGCTTGTTGACATAACACAGTGTG  >  minE/2496753‑2496813

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑