Missing coverage evidence...
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CTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATAAA  >  minE/2497163‑2497224 |                                                              cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTg        >  1:1109493/1‑56 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGtata    >  1:1181416/1‑60 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGtata    >  1:849128/1‑60 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:806659/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:518054/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:578792/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:599428/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:605508/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:65030/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:650340/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:674094/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:724643/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:782179/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:4978/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:840508/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:859512/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:87859/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:880517/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:927581/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:989754/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:316058/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:107991/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:109224/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:1102208/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:1177884/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:119416/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:147128/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:16283/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:213985/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:221072/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:1068812/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:327908/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:384963/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:400670/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:402369/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:425586/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaaa  >  1:466043/1‑62 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaa   >  1:690518/1‑61 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaa   >  1:783071/1‑61 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaa   >  1:349950/1‑61 (MQ=255) cTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATaa   >  1:59127/1‑61 (MQ=255) |                                                              CTCAATTTTCCCTTGCTGAAAAATTTTCCATTGTCTCCCCTGTAAAGCTGTGCTTGTATAAA  >  minE/2497163‑2497224

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑