Missing coverage evidence...
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CTCGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTG  >  minE/223137‑223198 |                                                              ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGgtg                       >  1:6930/1‑41 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGAttt   >  1:245622/1‑61 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGAttt   >  1:35108/1‑61 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGAttt   >  1:508001/1‑61 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGAttt   >  1:547184/1‑61 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGAttt   >  1:68135/1‑61 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGAtt    >  1:586653/1‑60 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:555546/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:881766/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:836998/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:788701/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:786262/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:755022/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:731455/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:723978/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:693831/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:612110/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:1046111/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:522950/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:385055/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:252163/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:221432/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:1190973/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:1065962/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTg  >  1:10539/1‑62 (MQ=255) ctcGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATACAGTGGATTTg  >  1:449388/1‑62 (MQ=255) |                                                              CTCGATGGCGATAACGCATGGGCATTAAGCGAAAGCTGGTGTGGCACTATTCAGTGGATTTG  >  minE/223137‑223198

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑