Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2539742	2539781	40	73 [0]	[0] 6	rfaJ	UDP‑D‑glucose:(galactosyl)lipopolysaccharide glucosyltransferase

CAGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGC  >  minE/2539782‑2539842 |                                                             caGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGc  <  1:1081622/61‑1 (MQ=255) caGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGc  <  1:267817/61‑1 (MQ=255) caGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGc  <  1:274393/61‑1 (MQ=255) caGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGc  <  1:559179/61‑1 (MQ=255) caGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGc  <  1:762676/61‑1 (MQ=255) caGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGc  <  1:813724/61‑1 (MQ=255) |                                                             CAGGTCTGGTCAAGAGCAATGTACTTCCGTTTATTTGCATTTCAATTATTGGGTTTAACGC  >  minE/2539782‑2539842

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑