Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2548275	2548291	17	9 [0]	[0] 27	htrL	hypothetical protein

TGAAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAG  >  minE/2548292‑2548352 |                                                             tgaTAGTTAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCAGATCTCAACAACAg  <  1:444705/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:353553/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:986128/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:938412/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:875162/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:842204/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:805200/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:797260/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:745289/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:70825/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:700328/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:682953/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:592283/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:583233/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:1010147/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:334715/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:287456/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:286403/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:285588/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:266597/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:158111/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:135612/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:1178628/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:1144567/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:1084909/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:1027837/61‑1 (MQ=255) tgaAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAg  <  1:1021949/61‑1 (MQ=255) |                                                             TGAAAGTAAGATGCATCTTTTCACTATAAAAAAAGGGCTTACTGTCACATCTCAACAACAG  >  minE/2548292‑2548352

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑