Missing coverage evidence...
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TTAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTG  >  minE/2565336‑2565396 |                                                             ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCAt                    >  1:594821/1‑43 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCATAGCCTg  >  1:1174078/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGc     >  1:740709/1‑58 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCt   >  1:151165/1‑60 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:296533/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:96907/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:823258/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:776748/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:692195/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:672066/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:656179/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:628648/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:604472/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:530279/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:453426/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:386014/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:315289/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1009553/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:218145/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:206289/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:188876/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1191338/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1147580/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1115709/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1111078/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1094805/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1064500/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1060145/1‑61 (MQ=255) ttAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTg  >  1:1058212/1‑61 (MQ=255) |                                                             TTAAGCTGATTTTGGAAATCAGCTCAGTCAGTGAAAGGACCATTGTTGATCGCACAGCCTG  >  minE/2565336‑2565396

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑