Missing coverage evidence...
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CAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGA  >  minE/2587862‑2587923 |                                                              cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCg      >  1:452936/1‑58 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTg   >  1:958934/1‑61 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:472646/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:96795/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:948244/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:942965/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:898210/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:864521/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:662513/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:608766/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:54512/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:540567/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:531469/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:505184/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:493056/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:488330/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:1012331/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:44922/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:39431/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:392891/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:376653/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:368567/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:322959/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:305217/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:299670/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:298241/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:282958/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:204227/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:1135368/1‑62 (MQ=255) cAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGa  >  1:1114230/1‑62 (MQ=255) |                                                              CAGCGAATCTGCCTGATTAGCGGTAACGAGTGCGCCGACGGTCACCGACGATTTCCCGCTGA  >  minE/2587862‑2587923

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑