Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2608523	2608685	163	20 [0]	[0] 18	[nikR]–[nikE]	[nikR],[nikE]

GAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTG  >  minE/2608686‑2608729 |                                            gAATAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:883841/44‑1 (MQ=255) gAAATGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:456595/44‑1 (MQ=255) gAAAATGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:854096/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:588814/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:989982/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:919836/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:801966/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:731241/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:693098/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:685546/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:1065652/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:550303/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:44548/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:330232/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:266173/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:243833/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTg  <  1:1128382/44‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGGTTCGACGATTTg  <  1:571658/44‑1 (MQ=255) |                                            GAAAAGGTTAATTTCTCTCCCACCACCTGGGTTTCGACGATTTG  >  minE/2608686‑2608729

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑