Missing coverage evidence...
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ATTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTCACCCACC  >  minE/2610173‑2610234 |                                                              aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcaccccc   >  1:49576/1‑59 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:824140/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:550956/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:56571/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:56945/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:594364/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:676108/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:694031/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:769092/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:785656/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:966682/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:833113/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:839924/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:841461/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:842861/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:875861/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:921557/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:950065/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:956250/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:403800/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1038460/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1045535/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1103758/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1122548/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1143242/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1153017/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1196956/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:156300/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:178695/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:242354/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:325069/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:364430/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:36545/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:369452/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:376519/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccacc  >  1:417536/1‑62 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcacccac   >  1:1172278/1‑61 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTcaccca    >  1:949671/1‑60 (MQ=255) aTTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGAGCAGTGCGTcacccacc  >  1:1020241/1‑62 (MQ=255) |                                                              ATTAGTGTGCGTGCTCCGTCACCAGATGAGGGTCCAGATGATCGCGCAGTGCGTCACCCACC  >  minE/2610173‑2610234

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑