Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2653314	2653545	232	70 [0]	[0] 56	glgA	glycogen synthase

ACCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCA  >  minE/2653546‑2653607 |                                                              aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:741472/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:500417/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:545609/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:573761/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:577051/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:586392/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:59698/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:629949/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:638214/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:6508/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:654097/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:702194/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:71793/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:719741/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:48535/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:749764/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:768740/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:797868/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:798918/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:818050/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:82044/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:834986/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:86502/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:893280/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:906286/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:916910/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:962444/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:963510/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:196457/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1034737/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1067081/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1070586/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1102531/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1117605/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1127961/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1142962/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1156013/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:14813/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:156943/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:158572/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:190042/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:195987/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:1007062/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:197879/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:200751/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:225007/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:227852/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:264784/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:266877/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:369631/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:397286/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:414008/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:415806/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:416874/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:446764/62‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCa  <  1:457292/62‑1 (MQ=255) |                                                              ACCTGGCCTATCAAGGCATGTTTTATGCACATCACATGAATGACATCCAATTGCCATGGTCA  >  minE/2653546‑2653607

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑