Missing coverage evidence...
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GAGATCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGA  >  minE/2653713‑2653774 |                                                              gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTTTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:169382/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTg   >  1:5878/1‑61 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:883432/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:683660/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:726067/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:744673/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:749075/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:77633/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:790397/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:795417/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:843394/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:660691/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:899156/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:912304/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:921047/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:941085/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:95260/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:9688/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:986174/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:401718/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:1022376/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:1073607/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:1097208/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:154386/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:290216/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:320439/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:33870/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:399956/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:671242/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:459186/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:538381/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:541826/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:572011/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:611924/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:63177/1‑62 (MQ=255) gagaTCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGa  >  1:1017851/1‑62 (MQ=255) |                                                              GAGATCACCGAACCGCAGTTTGCCTACGGTATGGAAGGTCTGTTGCAACAGCGTCACCGTGA  >  minE/2653713‑2653774

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑