Missing coverage evidence...
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TTACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGT  >  minE/2688711‑2688770 |                                                            ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAga  >  1:695236/1‑59 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAg   >  1:263692/1‑59 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:1027844/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:903822/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:858380/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:850826/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:807361/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:795383/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:788346/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:703166/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:69927/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:664158/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:606936/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:464951/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:457252/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:450065/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:418679/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:383980/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:344910/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:263300/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:169706/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:137653/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:1150349/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:1122859/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:1120555/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:1016478/1‑60 (MQ=255) ttACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCCGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:259511/1‑60 (MQ=255) ttACTACAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGt  >  1:948423/1‑60 (MQ=255) |                                                            TTACTTCAGGGTCTGGTTTGCTACCTGCTGATCGCCTGGCTTTCCGGAAAAAATCACAGT  >  minE/2688711‑2688770

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑