Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	239326	239543	218	33 [0]	[0] 41	[mak]	[mak]

CATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGC  >  minE/239544‑239605 |                                                              catgcatgATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTAc                        >  1:516830/1‑40 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:1003037/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCGTACAAAAGGTGc               >  1:578845/1‑49 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACGAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:434746/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACATAAGGTGCCAGAACCGTAgg   >  1:985579/1‑61 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGc               >  1:788591/1‑49 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAgg   >  1:560889/1‑61 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:793728/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:588588/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:596260/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:686154/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:691316/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:732871/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:527151/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:799604/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:80443/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:805177/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:82948/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:832138/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:949963/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:963620/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:977920/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:988236/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:457164/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:1025044/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:1045648/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:115400/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:125668/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:165032/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:171635/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:222264/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:236711/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:273891/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:284850/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:368753/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:410889/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:416693/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:437705/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:561456/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGACAGAACCGTAGGc  >  1:249218/1‑62 (MQ=255) catGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCATACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGc  >  1:343068/1‑62 (MQ=255) |                                                              CATGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAGGTGCCAGAACCGTAGGC  >  minE/239544‑239605

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑