Missing coverage evidence...
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TTTTACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCGG  >  minE/2727780‑2727841 |                                                              ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGTCATCGCgg  <  1:578421/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:67001/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:404559/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:420532/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:421042/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:473235/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:491306/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:507869/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:529820/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:53158/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:553917/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:587440/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:394320/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:671994/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:687998/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:759818/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:776840/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:844745/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:856777/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:864541/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:900448/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:923792/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:926425/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:94863/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:361571/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:1041721/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:1072423/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:1105652/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:110767/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:1133509/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:1160800/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:1161786/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:134906/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:151396/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:167899/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:183528/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:237720/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:263972/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:280769/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:287320/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:303197/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:304855/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:316471/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:324021/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:332347/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:341532/62‑1 (MQ=255) ttttACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:1021015/62‑1 (MQ=255) ttttACTAGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCgg  <  1:227061/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTTTACTCGCAGGAGTGCTGTTTCTCTTCGCGGCGGTGGCTGCGGTGCCGCTGGCATCGCGG  >  minE/2727780‑2727841

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑