Missing coverage evidence...
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TTGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGAT  >  minE/2753325‑2753385 |                                                             ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:602983/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:481047/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:483375/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:517621/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:528669/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:549717/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:583672/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:587387/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:588948/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:44273/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:703921/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:788121/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:797934/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:883091/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:920771/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:930113/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:951138/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:179907/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1033377/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1098240/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1111120/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1117115/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1156623/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1168368/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1178704/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:120812/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:1031470/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:23668/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:281980/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:324767/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:327378/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:363081/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:416589/61‑1 (MQ=255) ttGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGat  <  1:420931/61‑1 (MQ=255) |                                                             TTGCACTGGCAGGATTACACTCGCGCCGTTAAATAACCAACTGGAGTTTTTATGAGTCGAT  >  minE/2753325‑2753385

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑