Missing coverage evidence...
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TGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCATT  >  minE/2757329‑2757389 |                                                             tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTa                >  1:344146/1‑47 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:583851/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:895381/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:883879/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:856364/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:91073/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:794454/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:783647/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:781226/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:717523/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:691596/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:686830/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:612620/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:604790/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:593742/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:585330/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:546869/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:545608/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:527681/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:480415/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:444635/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:275802/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:257924/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:209709/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:199259/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:150019/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:1195042/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:1105662/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:1031143/1‑61 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAta  >  1:1072530/1‑60 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAt   >  1:965538/1‑60 (MQ=255) tGCAGTAATCGGGCAGCAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCAtt  >  1:815856/1‑61 (MQ=255) |                                                             TGCAGTAATCGGGCAGGAGAGCTTATAGAGCATATCACCGGTGTCTAAACCGACATCCATT  >  minE/2757329‑2757389

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑