Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 246809 246899 91 2 [0] [0] 23 phoR sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

TTATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGAA  >  minE/246900‑246960
|                                                            
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:403664/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:962359/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:880741/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:853321/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:828093/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:797200/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:772928/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:731625/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:678738/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:640317/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:514836/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:413585/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:100664/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:36917/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:293392/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:143153/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:12976/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:1169813/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:1141752/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:1136246/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:1131496/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGaa  <  1:1084785/61‑1 (MQ=255)
ttATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGAATCAACTGGaa  <  1:256655/61‑1 (MQ=255)
|                                                            
TTATACCCACAAACAGTTGCTGATGGTGGCGCGTGATGTCACGCAAATGCATCAACTGGAA  >  minE/246900‑246960

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: