Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2778505	2778563	59	8 [0]	[0] 60	iclR	DNA‑binding transcriptional repressor

GCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTG  >  minE/2778564‑2778625 |                                                              gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTTCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:300357/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCTCGAAACCCTGCTGTTg  >  1:421532/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCctgctg     >  1:862037/1‑59 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGtt   >  1:833198/1‑61 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGtt   >  1:290141/1‑61 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGtt   >  1:235018/1‑61 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGtt   >  1:212398/1‑61 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:424089/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:430307/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:458173/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:569535/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:680543/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:600263/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:602156/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:608510/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:624143/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:629379/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:660770/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:380887/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:721449/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:760977/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:768764/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:781726/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:782498/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:795955/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:823185/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:82370/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:840110/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:847564/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:908114/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:932347/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:971983/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:133015/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1026743/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1033826/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1055425/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1081403/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1084740/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1087406/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1098972/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1134272/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1141177/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1144701/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1152977/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:117381/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1187854/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:417771/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:158484/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:160783/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:172801/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:190690/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:193379/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:207044/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:258998/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:304461/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:354418/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:375887/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:1006264/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTg  >  1:413516/1‑62 (MQ=255) gCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACACTGCTGTTg  >  1:156821/1‑62 (MQ=255) |                                                              GCATGTGCGCCGATTGCCCAATGTCCCAGTTCGCCAACCTGACGCACGAAACCCTGCTGTTG  >  minE/2778564‑2778625

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑