Missing coverage evidence...
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AGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTG  >  minE/2783613‑2783672 |                                                            aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAg                     >  1:918068/1‑41 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:502023/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:1090515/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:505212/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:571027/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:658803/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:66546/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:672778/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:713057/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:758075/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:782870/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:816415/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:866318/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:867975/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:883800/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:896930/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:897973/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:900189/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:910167/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:222365/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:1062912/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:1096252/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:1108333/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:1142067/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:1143417/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:115680/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:1162102/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:141174/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:145980/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:350224/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:361591/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:38220/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:406254/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:424269/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:440070/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:47354/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtggtg  >  1:499600/1‑60 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCtgg    >  1:496085/1‑58 (MQ=255) aGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGGTTAAGCtggtg  >  1:955858/1‑60 (MQ=255) |                                                            AGTGCCGCCAATGCCGCAGCCCGCCGTGTCGCGCTGGGTAGTCTGCTGTTTAAGCTGGTG  >  minE/2783613‑2783672

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑