Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	248809	248843	35	2 [0]	[0] 30	brnQ	predicted branched chain amino acid transporter

ACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGC  >  minE/248844‑248890 |                                               aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:4526/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:99121/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:836615/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:798556/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:784994/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:765357/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:743240/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:731068/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:683160/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:646924/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:609705/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:579999/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:510899/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:495881/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:47487/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:108691/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:379194/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:333994/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:331785/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:328599/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:304926/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:302616/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:264214/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:186220/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:184278/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:127409/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:1190147/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:1166488/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:1124654/47‑1 (MQ=255) aCGGCGCTGCTATTCTGCATGC‑TACGTTCAGCACACCTTTggcggc  <  1:313889/46‑1 (MQ=255) |                                               ACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGC  >  minE/248844‑248890

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑