Missing coverage evidence...
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GAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGTGAT  >  minE/2863219‑2863280 |                                                              gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:737508/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:500625/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:504712/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:516424/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:540006/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:544924/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:572302/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:611342/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:645213/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:661231/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:704979/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:735664/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:495668/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:827095/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:830768/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:85411/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:858887/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:873163/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:893502/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:923444/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:925093/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:988415/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:995517/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:228606/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:1095660/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:1105170/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:1136613/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:1141987/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:137930/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:148288/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:151689/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:177431/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:187171/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:187641/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:200337/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:1082967/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:231062/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:240062/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:258802/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:270843/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:291770/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:343269/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:349858/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:405115/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:406310/62‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGtgat  <  1:452/62‑1 (MQ=255) |                                                              GAAGCGGTGAATACGGTTCTTGAAGAGATCGACGCTCACGAGATCCCAACCCTGCTGGTGAT  >  minE/2863219‑2863280

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑