Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2884671	2884723	53	29 [0]	[0] 66	cpdB/cysQ	2':3'‑cyclic‑nucleotide 2'‑phosphodiesterase/PAPS (adenosine 3'‑phosphate 5'‑phosphosulfate) 3'(2'),5'‑bisphosphate nucleotidase

TTGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACAGAG  >  minE/2884724‑2884783 |                                                            ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACaa                        >  1:387488/1‑38 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAg                    >  1:530358/1‑42 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAacac             >  1:978797/1‑49 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACGGCTCACagag  >  1:96619/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTcac      >  1:1186877/1‑56 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:606458/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:672592/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:649325/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:644247/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:63961/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:633458/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:629377/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:622913/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:614496/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:726999/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:598469/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:593484/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:577223/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:575602/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:573020/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:687872/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:538980/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:755187/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:769335/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:777102/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:808332/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:832501/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:837228/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:837763/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:846416/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:856789/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:935864/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:941941/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:951725/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:1014163/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:309557/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:1112594/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:11178/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:1161617/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:1201732/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:154238/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:154561/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:183375/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:184976/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:196889/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:224080/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:227477/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:228439/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:2821/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:297838/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:302837/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:565920/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:311439/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:3336/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:350197/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:353870/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:358728/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:1021778/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:444466/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:448322/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:472583/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:510410/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:512657/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:1018987/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACagag  >  1:1035536/1‑60 (MQ=255) ttGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACaga   >  1:505575/1‑59 (MQ=255) |                                                            TTGGCGCATTCATTAACGATAGGGTATAAGTAAAACAATAAGTTAACACCGCTCACAGAG  >  minE/2884724‑2884783

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑