Missing coverage evidence...
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TCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAA  >  minE/2891599‑2891658 |                                                            tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:52848/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:990410/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:983009/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:878511/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:821826/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:772488/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:764619/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:692231/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:589954/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:1074161/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:470049/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:37621/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:371018/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:20541/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:127884/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:1201637/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:1143782/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:1125666/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:1118198/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:1075380/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGGTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:581673/60‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGGGCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGaaa  <  1:721899/60‑1 (MQ=255) |                                                            TCGCTCCGGTGGTCGCGACAGGTTGGGAACCGGTATTAAAAGAGGCGAAAGATGCCGAAA  >  minE/2891599‑2891658

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑