Missing coverage evidence...
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CGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTGTTG  >  minE/2966536‑2966598 |                                                               cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGCCCTGGCTg     >  1:18911/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCt      >  1:178593/1‑59 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:425829/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:971377/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:764680/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:752458/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:743853/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:715201/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:642606/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:598355/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:576298/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:57237/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:538570/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:483463/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:451309/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:449446/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:1019215/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:421275/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:349382/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:328957/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:315514/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:315090/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:303908/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:280960/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:229545/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:141483/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:1070732/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:1033075/1‑60 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGT‑ACCGTCACGACCTGGCTGTTg  >  1:791428/1‑62 (MQ=255) cGTTTATCGGCGACAAAGACGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTg     >  1:175995/1‑60 (MQ=255) |                                                               CGTTTATCGGCGACAAAGCCGGTAACTTCCAGCGTACCGGTAACCGTCACGACCTGGCTGTTG  >  minE/2966536‑2966598

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑