Missing coverage evidence...
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GTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCT  >  minE/2968155‑2968216 |                                                              gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAg                           >  1:1441/1‑37 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:374630/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:997081/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:949928/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:830359/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:799980/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:587558/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:582333/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:577757/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:514914/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:476762/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:434958/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1002207/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:251831/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:235549/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:138794/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:13151/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1197604/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1146398/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1131962/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1080583/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1047027/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1033544/1‑62 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgc   >  1:626964/1‑61 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgc   >  1:995075/1‑61 (MQ=255) gttgCCAGAGAAGATCGGGTGATTAGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCActgct  >  1:1037438/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTTGCCAGAGAAGATCGGGTGATTCGCTTTGGTAAAGCACGGGCAACGCGATATGCACTGCT  >  minE/2968155‑2968216

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑