Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2968983	2968984	2	21 [0]	[0] 46	yjjJ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

GGCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCAC  >  minE/2968985‑2969024 |                                        ggCAATGCGGCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:888163/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:793475/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:1099104/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:616216/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:654466/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:671164/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:680320/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:696762/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:697625/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:698531/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:724218/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:740024/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:759410/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:608210/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:794988/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:82363/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:891517/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:916026/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:927433/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:935307/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:942924/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:980913/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:98677/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:182965/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:116354/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:1170311/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:117914/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:1182741/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:122181/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:146404/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:159014/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:172877/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:179277/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:179794/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:603124/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:213730/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:220110/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:231636/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:398421/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:457383/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:494732/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:520098/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:575965/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:586061/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactcac  >  1:594605/1‑40 (MQ=255) ggCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGtcactca   >  1:794942/1‑39 (MQ=255) |                                        GGCAATGCGCCGTTTGTGTGAGCAACAACTTGTCACTCAC  >  minE/2968985‑2969024

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑