Missing coverage evidence...
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CTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAT  >  minE/2984488‑2984547 |                                                            cTGTAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1076823/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:605880/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:362560/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:416/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:462601/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:504799/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:532451/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:536341/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:570308/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:585247/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:181961/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:78395/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:809030/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:841583/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:89287/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:929689/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:963133/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:291810/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1046367/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:164490/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:15936/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:124383/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:123284/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:120234/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1157636/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1154573/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:115428/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1137129/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1130319/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1079038/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1065362/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:10537/60‑1 (MQ=255) cTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAt  <  1:1052558/60‑1 (MQ=255) |                                                            CTGGAAAATGACTAGCCTGTTTGGTGCAGTATTGCTGTTGTTGATTCCGATAATGCTGAT  >  minE/2984488‑2984547

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑