Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	2986462	2986555	94	4 [0]	[0] 47	arcA	DNA‑binding response regulator in two‑component regulatory system with ArcB or CpxA

ACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCA  >  minE/2986556‑2986616 |                                                             aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCTGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:435734/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTg                         >  1:198549/1‑38 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGttt                  >  1:860376/1‑45 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGcc   >  1:97887/1‑60 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGcc   >  1:1035860/1‑60 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:709355/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:396531/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:972907/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:474037/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:48995/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:491949/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:510879/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:592663/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:607897/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:678322/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:906818/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:722132/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:740183/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:75144/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:796779/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:935739/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:811541/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:833650/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:85681/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:919432/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:249487/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:1077246/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:1083966/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:1111609/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:1112723/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:1117171/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:1125870/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:117890/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:178379/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:180920/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:199749/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:432785/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:258398/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:262741/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:274267/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:285317/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:291206/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:314811/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:344113/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:349191/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:391925/1‑61 (MQ=255) aCCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCa  >  1:393137/1‑61 (MQ=255) |                                                             ACCAACTCGTCTTCAACGATAAGAATGTGCGGGGTCTGCATGTTTGCTACCTAAATTGCCA  >  minE/2986556‑2986616

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑