Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	339371	339856	486	2 [0]	[0] 14	[copA]	[copA]

CCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCA  >  minE/339857‑339917 |                                                             ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGa        >  1:548363/1‑55 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:1081618/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:1199506/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:177388/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:182044/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:209906/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:307877/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:496662/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:5871/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:608275/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:641125/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:646329/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:703901/1‑61 (MQ=255) ccTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCAAGCAAGGGGAAGGTCa  >  1:970899/1‑61 (MQ=255) |                                                             CCTTTAAGACAGTTTTGACTGGCTGTGATAAAGGTTAAACCTTCCAGCAAGGGGAAGGTCA  >  minE/339857‑339917

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑