Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 358369 358546 178 38 [0] [0] 106 sfmC pilin chaperone, periplasmic

Only 100 of 106 total aligned reads displayed.

GTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTT  >  minE/358547‑358608
|                                                             
gTTCATGATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:1172350/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCTATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTAc                     >  1:368430/1‑43 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACaa                   >  1:640352/1‑45 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAg                  >  1:971498/1‑46 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAg                  >  1:958225/1‑46 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCaa       >  1:4763/1‑57 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAGGtt  >  1:493288/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:673884/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:650528/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:648962/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:640497/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:686817/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:708148/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:621482/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:617970/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:608291/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:69513/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:594729/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:571427/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:571117/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:567515/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:561640/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:558076/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:530432/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:523457/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:492237/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:484189/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:880990/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:990622/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:99042/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:973427/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:969279/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:964210/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:951436/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:945542/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:942190/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:939272/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:937188/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:889874/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:696849/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:867771/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:837777/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:808281/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:806228/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:78356/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:774986/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:717908/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:716324/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:712550/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:453908/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:699614/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:115180/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:164558/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:161318/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:15741/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:157015/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:145388/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:142535/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:133163/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:125614/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:123024/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1167280/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:115380/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:178823/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:1143023/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:1136731/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1130248/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:1120200/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1101517/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1100347/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:106425/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1058056/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:1054170/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1047817/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1037594/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:354310/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:1005519/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:442809/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:44008/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:439087/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:438219/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:434477/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:433806/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:41843/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:403630/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:366297/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:364261/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:462719/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:3307/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:328254/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:326258/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:296039/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:278385/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:274647/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:250992/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:211609/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  >  1:201703/1‑62 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:200960/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGtt  <  1:194776/62‑1 (MQ=255)
gTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGt   >  1:1050669/1‑61 (MQ=255)
|                                                             
GTTCATAATCCATCACCTTTTTATGTCACCCTGGTTAACTTACAAGTGGGCAGCCAAAAGTT  >  minE/358547‑358608

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑