Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	360599	360748	150	6 [0]	[0] 46	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

GCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACCG  >  minE/360749‑360789 |                                         gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:685777/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:499742/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:507957/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:520330/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:569718/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:585561/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:586933/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:613838/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:618355/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:619312/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:632217/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:646703/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:440206/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:688689/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:755670/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:830950/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:844455/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:852033/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:860108/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:88632/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:913280/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:963826/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:980603/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:134486/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1045898/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1085800/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1110100/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1114943/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1133961/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1136736/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1174937/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:117630/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1186750/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1187835/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1195957/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:1030919/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:177393/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:215026/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:227072/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:228361/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:31066/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:364423/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:364501/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:377312/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:423045/41‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACcg  <  1:428610/41‑1 (MQ=255) |                                         GCCGCTTACGGTACGCTGGGGGGCGGGTATAACTACGACCG  >  minE/360749‑360789

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑