Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	362995	363019	25	30 [0]	[0] 32	fimZ	predicted DNA‑binding transcriptional regulator

TTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAC  >  minE/363020‑363080 |                                                             ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGTCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:623314/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATaa   >  1:560018/1‑60 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATaa   >  1:940396/1‑60 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATaa   >  1:834769/1‑60 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATaa   >  1:532949/1‑60 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATaa   >  1:475320/1‑60 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATaa   >  1:1111414/1‑60 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATa    >  1:622902/1‑59 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:399784/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:938823/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:929291/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:925501/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:1121007/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:792059/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:736280/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:703822/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:693849/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:689010/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:676232/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:674341/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:565410/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:1030495/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:557969/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:29909/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:501496/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:311958/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:47378/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:434278/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:407814/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAc  >  1:377448/1‑61 (MQ=255) ttATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATAAGATAATCCg               >  1:205854/1‑48 (MQ=255) ttATAGCTAAGTAATAACTGATCGGCAATTTCTTTATTAGAt                     >  1:524950/1‑42 (MQ=38) |                                                             TTATTGCTAAGTAATAACTTATCGGCAATTTCTTTATTAGATAATCCGCTAACCAGATAAC  >  minE/363020‑363080

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑