Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	479591	479713	123	46 [0]	[0] 63	cydB	cytochrome d terminal oxidase, subunit II

CTGCCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTG  >  minE/479714‑479775 |                                                              ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCg                            >  1:1046375/1‑36 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGTGATGATCCTCGTg  >  1:646029/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCt      >  1:1037132/1‑58 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:645212/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:765061/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:761743/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:757230/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:754692/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:73919/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:709109/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:645292/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:769806/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:608292/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:583754/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:580123/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:548922/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:535792/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:768236/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:493327/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:780728/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:784080/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:785461/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:793800/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:808007/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:826429/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:840347/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:845794/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:907531/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:919851/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:940829/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:9612/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:980617/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:290539/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:1016961/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:1060414/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:1076290/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:108801/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:1128393/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:1142112/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:116212/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:1192633/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:147214/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:178277/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:192980/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:236021/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:238473/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:240398/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:28141/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:497964/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:312855/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:318279/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:327277/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:34393/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:364869/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:379399/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:428619/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:435085/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:45130/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:460759/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:462520/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:465041/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTg  >  1:1005275/1‑62 (MQ=255) ctgcCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCATCGTg  >  1:589431/1‑62 (MQ=255) |                                                              CTGCCTGGCCGATGGTCTATGCCGCTGCGTTCTCCGGCTTCTATGTGGCGATGATCCTCGTG  >  minE/479714‑479775

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑