Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	488190	488348	159	37 [0]	[0] 100	lysQ/nadA	tRNA‑Lys/quinolinate synthase, subunit A

TACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAG  >  minE/488349‑488410 |                                                              tACTGTGCAATCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTa   >  1:844050/1‑61 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTaaaa                      >  1:976001/1‑42 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTg          >  1:296053/1‑54 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACAtt    >  1:1137652/1‑60 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACAtt    >  1:1417/1‑60 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACAtt    >  1:943736/1‑60 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTa   >  1:897898/1‑61 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTa   >  1:487178/1‑61 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:700377/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:649354/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:721511/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:721837/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:746442/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:746914/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:764823/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:783010/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:805636/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:809098/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:667360/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:655263/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:539901/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:643065/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:631485/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:593808/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:593592/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:586594/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:577692/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:552920/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:543567/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:526208/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:930480/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:9905/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:984755/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:977703/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:973222/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:960927/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:959289/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:951774/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:950708/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:942747/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:942050/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:810852/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:926958/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:918104/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:916989/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:912187/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:909279/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:893955/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:889148/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:872125/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:828057/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:827484/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:22913/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:365809/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:351606/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:351057/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:331418/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:316735/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:29958/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:297666/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:290135/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:269755/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:25027/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:243822/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:366040/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:192119/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:182821/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:176765/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:147697/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1167818/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1140797/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1135246/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1132798/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1064278/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1025737/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1018871/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:451182/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:527350/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:1002418/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:521429/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:515755/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:506989/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:49887/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:476242/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:47439/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:473536/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:466797/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:453176/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:531195/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:450361/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:449722/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:446765/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:414102/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:411395/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:404813/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:394516/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:38933/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:381827/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:374197/1‑62 (MQ=255) tACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAg  >  1:373333/1‑62 (MQ=255) |                                                              TACTGTGCAAGCAACTCTATGTCGGTGGAATTAGGCGTAAAATGACGCATCCTGCACATTAG  >  minE/488349‑488410

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑