Missing coverage evidence...
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GACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTGCG  >  minE/547510‑547571 |                                                              gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGc          >  1:629276/1‑54 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:740392/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:609644/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:62705/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:645528/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:666380/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:668365/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:671272/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:686886/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:689618/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:601149/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:742911/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:780715/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:818264/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:822222/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:836346/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:870726/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:917059/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:930805/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:968897/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:348814/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:1180940/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:164118/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:253327/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:325716/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:340104/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:3425/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:1163744/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:351231/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:39058/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:405227/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:472486/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:491135/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:505963/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:546963/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgcg  >  1:563536/1‑62 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgc   >  1:172749/1‑61 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgc   >  1:164731/1‑61 (MQ=255) gACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTgc   >  1:163403/1‑61 (MQ=255) |                                                              GACCGTCACTTCCTTAACATGGTCTGTACCCACATGGCGGATCTGGATTACGGCGAGCTGCG  >  minE/547510‑547571

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑