Missing coverage evidence...
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GCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAT  >  minE/556961‑557022 |                                                              gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:509424/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:944861/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:90851/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:888047/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:717339/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:710197/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:708530/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:697356/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:690957/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:626997/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:524145/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:514165/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:1000154/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:501150/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:449610/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:407170/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:193009/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:167377/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:163813/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:135416/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:129791/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:1100364/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:1045149/62‑1 (MQ=255) gCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAt  <  1:1016752/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCCTTCCGGCACCGGCGCACCGGTCATAATACGAATGCAGGTACCCGCAGGCCATTCACCAT  >  minE/556961‑557022

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑